Análisis Digital de Imágenes

Módulo	Tema	Contenidos
1	Introducción al análisis digital de imágenes	∙ Análisis digital de imágenes. ¿Por qué? ¿Cómo? ¿Cuándo? ∙ Los 5 pasos involucrados en el análisis digital de imágenes ∙ Software
2	Imágenes digitales	∙ Digitalización. Tipos de cámaras  ∙ Profundidad de bits ∙ Tipos de imágenes. Formatos ∙ Histograma ∙ Segmentación. Seudocolor
3	Teoría del color	∙ Percepción del color ∙ Características del color  ∙ Modelos de color ∙ Modos de color
4	Nociones de fotografía. Operaciones y filtros	∙ Nociones de fotografía: profundidad de campo sensibilidad de películas/sensores temperatura de color tamaño de imagen y resolución resolución óptica y resolución digital tipos de imágenes. Parámetros. Resolución ∙ Operaciones y filtros: operaciones matemáticas filtros lineales y no lineales
5	FIJI (ImageJ con “baterías incluidas”). Operaciones usuales	∙ Planificación de un experimento con imágenes  ∙ ImageJ/Fiji: Introducción al menú principal  ∙ Imágenes:  Procesamiento - Análisis ∙ Información de una imagen digital. Mediciones, calibración. Análisis de algunos parámetros: longitudes, área, volumen, selección ROI ∙ Correcciones y conversiones de imágenes (histogramas, brillo, contraste, ruido, Look-Up tables). Filtros. Plugins. Análisis de partículas
6	Macros	∙ Introducción a macros ∙ Parte I: Elementos del lenguaje y operaciones ∙ Parte II: Funciones ∙ Parte III: Ejecución y depuración ∙ Recomendaciones de implementación
7	Análisis digital de geles	∙ Introducción al Gel Analyzer: selección de imágenes detección de calles y bandas corrección del fondo calibraciones ∙ Problemas frecuentes en el análisis de geles

El curso se desarrollará bajo modalidad virtual, mediante la plataforma SIED UNR-Carreras y Cursos. Acreditada por CONEAU. Plataforma educativa: Moodle.

Los contenidos están organizados en unidades temáticas (módulos). Estas unidades se desarrollarán durante las semanas de dictado de acuerdo con el cronograma establecido.

Además, se prevé la realización de 6 encuentros sincrónicos a través de Google Meet, en los cuales se resolverán las actividades propuestas, se dialogará sobre los contenidos y se evacuarán dudas acerca de los temas desarrollados.

Los contenidos del curso se presentarán en clases filmadas (y se utilizará una presentación de PowerPoint como soporte), en clases escritas y/o hipermediales, además de contar con bibliografía de consulta. El desarrollo de las actividades se realizará tanto a través del trabajo autónomo de los/as estudiantes como también mediante el trabajo colaborativo de los/as estudiantes con la guía de los/as docentes (en los encuentros sincrónicos y a través de la interacción en el foro).

 

Condiciones de aprobación:
- porcentaje de asistencia a los encuentros por Meet: 80%;
- aprobación de las actividades evaluativas propuestas.


Metodología de evaluación:
- resolución de un cuestionario mediante la utilización de la herramienta Examen disponible en la plataforma Moodle (modalidad individual, asincrónica);
- análisis de casos/resolución de problemas (modalidad grupal, con presentación escrita del informe y presentación oral del trabajo en un encuentro sincrónico para compartir y dialogar sobre el análisis realizado por cada grupo).

 

Los encuentros sincrónicos serán los días miércoles 29/4, 06/5, 13/5, 20/5, 27/5 y 03/06 de 15 a 17hs.

Directora:
Dra. María de Luján Álvarez

Docentes:
Bioq. José M. Pellegrino (docente FCByF, UNR, actualmente jubilado)
Dra. María de Luján Álvarez (FCByF, UNR)
Dra. Ana María González (UNNE-CONICET)


 

María de Luján Alvarez:
Es Bioquímica por la Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas, Universidad Nacional de Rosario (FBioyF, UNR); Doctora en Ciencias Biológicas por la UNR; y profesora superior por la Universidad Católica Argentina; además posee una Especialización en Educación de las Ciencias Experimentales por la FBioyF, UNR.
Es Directora Académica del Departamento de Ciencias Fisiológicas, en la Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas, UNR; Directora Académica del Área Morfología del Departamento de Ciencias Fisiológicas en la Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas, UNR; Responsable Académica del Servicio de Histotecnología del Área Morfología de la Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas, UNR.
Además, es miembro de las siguientes comisiones: Miembro Titular de la Comisión Académica de la Carrera de Doctorado en Ciencias Biológicas, Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas, UNR y Presidente del Comité Institucional para el Cuidado y Uso de Animales de Laboratorio (CICUAL), Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas, UNR.
Es investigadora independiente (Carrera del Investigador Científico y Tecnológico- CONICET) e investigadora independiente (Carrera del Investigador Científico de la UNR). Posee 48 trabajos originales publicados con referato; 2 revisiones; 1 capítulos de libro; 2 comunicaciones breves; 150 resúmenes en revistas de edición periódica. Ha dirigido 6 tesis de grado; ha sido directora o codirectora de 7 becarias y becarios (finalizados) y 2 (en curso); ha dirigido 4 pasantías universitarias y dirigido o codirigido 2 tesis doctorales (finalizadas) y 4 (en curso).

 

José Manuel Pellegrino:
Bioquímico egresado de la Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas de la Universidad Nacional de Rosario, Argentina. Docente desde 1979 en el Departamento de Ciencias Fisiológicas de dicha facultad, su último cargo docente fue como jefe de trabajos prácticos, entre 1989 y 2020. Actualmente, se encuentra jubilado. Ha dictado numerosos cursos de posgrado, y ha dirigido los cursos Introducción al análisis digital de imágenes (2002-2020) y Microscopía confocal cuantitativa (2011-2020), en la FBioyF-UNR. Ha sido docente invitado a 5 cursos de posgrado internacionales (Colombia, 2014, 2017 y 2018). Se ha desempeñado como personal de apoyo a la Investigación Científica y Tecnológica, Categoría Profesional Principal. Miembro de Junta Técnica de Evaluación de CONICET (2010-2012). Cuenta con numerosas publicaciones científicas y presentaciones a congresos. Ha dirigido pasantías y ha llevado adelante entrenamiento y supervisión de personal técnico en CONICET. Ha desempeñado numerosos roles en gestión universitaria, entre las que se destaca la participación en jurados de concursos docentes, en comisiones asesoras y como consejero directivo.

 

Ana María González
Ingeniera Agrónoma por la Facultad de Ciencias Agrarias de la Universidad Nacional del Nordeste, Argentina. Doctora en Ciencias Biológicas por la Universidad Nacional de Córdoba, Argentina. Realizó su posdoctorado en la University of Texas, Estados Unidos. Es investigadora principal de CONICET. En la actualidad, dirige el proyecto “Estudios Morfo-anatómicos y embriológicos de especies vegetales de interés agrícola”. Es directora del Instituto de Botánica del Nordeste (UNNE-CONICET). Se desempeña como profesora titular (por concurso) en la UNNE y en la Universidad Nacional del Chaco Austral, Argentina. Dirige la revista Boletín de la Sociedad Argentina de Botánica. Es editora de los sitios web Hipertextos del área de la Biología (www.biologia.edu.ar) y Botánica morfológica (www.botanica.unne.edu.ar). Proyectos en ejecución: Agencia (PICT-2018-1726 y 2021-IA-268), PIP-CONICET y PI-UNNE. Forma parte del Consejo Regional INTA Chaco-Formosa en tanto representante de la comunidad científica. Cuenta con numerosos trabajos publicados, libros y capítulos de libros, así como presentaciones en congresos nacionales e internacionales. Asimismo, ha dirigido cinco tesis doctorales finalizadas y es directora de otras dos que se encuentran en curso.